(1) Lựa chọn thiết bị. Có một số vấn đề trong việc lựa chọn thiết bị dược phẩm, chẳng hạn như lựa chọn theo kinh nghiệm (không tính toán thực tế hoặc tính toán dữ liệu không đầy đủ), theo đuổi sự tiến bộ một cách mù quáng và không điều tra đầy đủ dữ liệu vật lý, ảnh hưởng nghiêm trọng đến tính thực tiễn và tính kinh tế của thiết bị.

(2) Lắp đặt và đào tạo thiết bị. Trong quá trình lắp đặt thiết bị dược phẩm, tiến độ thi công thường được chú trọng mà bỏ qua chất lượng thi công, dẫn đến chi phí bảo trì thiết bị tăng cao về sau. Ngoài ra, việc đào tạo nhân viên bảo trì và vận hành thiết bị chưa đầy đủ cũng gây ra rủi ro cho công tác quản lý và bảo trì thiết bị dược phẩm.

(3) Đầu tư chưa đầy đủ cho quản lý và bảo trì thông tin. Hiện nay, mặc dù nhiều doanh nghiệp rất coi trọng việc quản lý và bảo trì thiết bị, cũng như quản lý hồ sơ bảo trì thiết bị và ghi chép các thông số cơ bản, nhưng vẫn còn tồn tại một số vấn đề, chẳng hạn như khó cung cấp dữ liệu bảo trì liên tục, thiếu thông tin hiệu quả về thông số kỹ thuật thiết bị dược phẩm, chẳng hạn như thông số kỹ thuật, bản vẽ, v.v., điều này vô hình chung làm tăng thêm khó khăn cho việc quản lý, bảo trì và tái thiết thiết bị.

(4) Hệ thống quản lý. Thiếu hệ thống và phương pháp quản lý hiệu quả, dẫn đến việc quản lý nhân viên bảo trì thiết bị dược phẩm không đầy đủ, công việc của nhân viên bảo trì thiếu chuẩn hóa, quy trình quản lý và bảo trì thiết bị dược phẩm tiềm ẩn nguy cơ mất an toàn.